《潜伏》讲述了1945年抗日战争胜利后，中共地下党员余则成潜伏在国民党军统天津站的故事。

余则成原本是军统外勤，因不满国民党腐败，在恋人左蓝影响下秘密加入共产党。组织安排他留在天津站，代号“峨眉峰”。为更好开展工作，他与组织派来的女游击队员翠平假扮夫妻。

初到天津站，余则成凭借谨慎和智慧站稳脚跟。他先后与站长吴敬中、情报处长陆桥山、行动队长马奎等周旋。马奎怀疑余则成身份，调查中反被设计陷害，最终被处决。陆桥山野心勃勃，与副站长李涯明争暗斗，余则成巧妙利用二人矛盾，既保护了自己，又为组织传递关键情报。

翠平初期因缺乏特工经验屡屡犯错，与余则成冲突不断，但在共同经历生死考验后，两人渐生情愫。李涯是军统老牌特务，敏锐察觉到余则成的异常，多次设下圈套试探。余则成在翠平及上线“秋掌柜”的协助下，一次次化险为夷，还成功获取了国民党“黄雀计划”等重要情报。

随着解放战争推进，天津站风雨飘摇。秋掌柜为保护余则成牺牲，翠平身份暴露被迫撤离。余则成在完成最后任务后，为继续潜伏，不得不与新的搭档晚秋结婚，前往台湾。结尾处，他与翠平遥遥相望却无法相认，留下无尽唏嘘。

全剧以紧凑的情节、复杂的人物关系，展现了地下工作者的智慧与牺牲，成为谍战剧的经典之作。